Bloodlines setzt Altaïrs Geschichte nach dem ersten Assassin’s Creed fort. Auf Zypern verfolgt der Assassine verbliebene Templer und begegnet Maria Thorpe erneut.
Der Hub sammelt veröffentlichte Beiträge, die dieses eigenständige Spiel unmittelbar behandeln. Erweiterungen, Bundles und bloße Plattformfassungen bleiben beim jeweiligen Hauptprodukt.